Shea树基因组测序

科学家已经解释了这种基因组冰树(Vitellaria Paradoxa.,一个独特的制剂树种类中央在非洲苏丹 - 萨赫州农岛鸡刀杂交皮带上维持当地生计和农村社区农业环境。

在丰美的雨季,在加纳北部博勒镇附近的一处牛油果公园里生长着牛油果树,是制作牛油果黄油的原料。图片来源:伊阿古·黑尔/新罕布什尔大学。

在丰美的雨季,在加纳北部博勒镇附近的一处牛油果公园里生长着牛油果树,是制作牛油果黄油的原料。图片来源:伊阿古·黑尔/新罕布什尔大学。

剪刀是一个小于中等大小的落叶树,通常在7到15米高之间,偶尔标本为25米。

被引用作为非洲之后的第二个最重要的石油作物,在油掌之后,苏丹 - 萨赫洛岛地区的最经济和文化重要的土着树种,油棕不生长。

Rural families in hundreds of thousands of villages across the so-called ‘shea belt,’ a 500-750 km wide semi-arid area stretching 6,000 km and spanning 21 countries from Senegal to South Sudan, use shea in their daily lives as an edible butter/oil, soap, cosmetic, and medicine.

牛油也是一种价值数百万美元的出口商品,作为奢侈品化妆品、个人护理和药品的成分。

然而,牛油果最大的出口需求(90%)与可食用硬脂酸的提取有关。可食用硬脂酸用于制作巧克力糖果用的可可脂。

基于人口和日常乳木果油消耗数据,在剪刀腰带中占用乳酸螺母系列的女性数量估计超过1800万。

事实上,谢伊被称为“女性的金”,因为它是该地区农村家庭成员的少数资源之一,从收获商业化。

销售Shea产品允许妇女为自己和孩子确保额外的食物,曾经谷类收割则耗尽并为家庭费用产生现金,包括服装,医学和学费。

Shea可用性的季节性对农户营养的营养也至关重要。乳酸水果是唯一可广泛的富能富能的食品来源,当时土地是耕种,在干燥季节的末端种植作物。

当粮食中的谷物库存是最低的粮食体股票的谷物储存最低和劳动力要求,果实在此年度“饥饿的季节”中提供了大量的蛋白质,糖,钙,钾和必需的脂肪酸,以及降雨的境地准备的劳动力要求。

尽管需求日益增长,但增长缓慢的冰树正在受到其他现金作物的威胁,其保存最有可能在其遗传改善方面。

“剪刀可能需要25年或更长时间来生产,因此对于农民等待这一点来说,这可能是非常昂贵的,并且想知道一棵树是否值得保守,”农业部的研究人员Iaga Hale博士说新罕布什尔大学的营养和食品系统。

“随着这么长的增长期,传统的育种策略根本不可行,这是一个原因是没有任何高性能的乳头品种。”

“乳酸基因组将使研究人员能够在发芽和通过基因组的树选择时立即衡量幼苗的潜力,我们可以在这种困难的物种上开始移动针。”

在这项新研究中,黑尔博士和同事们为牛油果树组装了一个染色体规模的参考基因组。

团队的基因组注释导致鉴定38,505个编码基因。

用的树木多样集合进一步的比较测序揭示近350万天然的遗传变异,称为单核苷酸多态性(SNP),可被用于区分树木并开始了解底层重要属性的遗传学。

“由于替代方案的威胁,冰淇淋很大,通常是男性控制的现金作物,如腰果和芒果,以及割草机的直接屈服于柴油,”Hale说。

“女性需要长途跋涉去采集乳木果,这意味着更多的劳动和更少的利润。”

“抵消这些趋势,我们需要提高冰刀的价值。基因组辅助育种具有实现这一目标的路径。“

利用新绘制的基因组,研究小组还在牛油果中发现了45个脂肪酸生物合成基因,它们可能控制着硬脂素的含量。

能够识别这些酶可以帮助研究人员为幼苗开发更好的选择策略。

研究人员表示,“与这些资源有关这些资源,以支持剪刀队的国家方案,以战略,基因组的保护和长期改善Shea-Sudanian Africa的Shea Tree,”。

结果出现在杂志上植物科学前沿

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Iago Hale..基因组资源指导牛油果树的改良。正面。植物SCI.,在线发布于2021年9月9日在线;DOI:10.3389 / FPLS.2021.720670

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